Die\u00a0Genexpressionsanalyse\u00a0untersucht, welche Gene in einer Probe aktiv sind und in welcher St\u00e4rke ihre RNA nachweisbar ist. Sie macht biologische Prozesse in Zellen und Geweben messbar und schafft objektive molekulare Ergebnisse f\u00fcr klar definierte Fragestellungen. In der Dermatologie kann sie klinische und histopathologische Befunde um eine standardisiert messbare Ebene erweitern.<\/p>\n\n\n\n
Gene enthalten die Bauanleitung f\u00fcr RNA und Proteine. Ob ein Gen in einer bestimmten Zelle aktiv ist, h\u00e4ngt unter anderem vom Zelltyp, Entz\u00fcndungszustand und biologischen Umfeld ab. Bei der Genexpression wird genetische Information zun\u00e4chst in RNA \u00fcbertragen. Die Menge einer spezifischen RNA kann deshalb als Hinweis auf die Aktivit\u00e4t des zugeh\u00f6rigen Gens dienen.<\/p>\n\n\n\n
Eine\u00a0Genexpressionsanalyse\u00a0misst diese RNA-Signale gezielt oder \u00fcber eine gr\u00f6\u00dfere Zahl von Genen hinweg. Ziel ist nicht allein der Nachweis eines einzelnen Gens, sondern die Einordnung charakteristischer Expressionsmuster. Dabei werden Ergebnisse immer im jeweiligen Proben-, Untersuchungs- und Anwendungskontext bewertet.<\/p>\n\n\n\n
Bei einer zielgerichteten Analyse werden vorab definierte Biomarker gemessen. Ein typischer Workflow umfasst die Probenvorbereitung, RNA-Extraktion, Umschreibung der RNA in komplement\u00e4re DNA und die quantitative Messung ausgew\u00e4hlter Zielgene mittels RT-qPCR. Die gemessenen Signale werden anschlie\u00dfend nach einem festgelegten Auswerteverfahren zu einem Ergebnis zusammengef\u00fchrt.<\/p>\n\n\n\n
Die Qualit\u00e4t der Probe, eine standardisierte Durchf\u00fchrung und eine nachvollziehbare Auswertung sind entscheidend f\u00fcr belastbare Ergebnisse. Bei vergleichenden Analysen ist zudem eine geeignete Normalisierung erforderlich, damit technische Unterschiede nicht f\u00e4lschlich als biologische Expressionsunterschiede interpretiert werden.<\/p>\n\n\n\n
F\u00fcr einen geschlossenen, automatisierten Workflow in der RT\u2011qPCR b\u00fcndelt die LabDisk-Kartusche<\/a> Probenvorbereitung, Messung und Auswertung. Die Ausf\u00fchrung und Analyse erfolgen auf dem System Vollautomatisierter Analyzer f\u00fcr molekulare Tests<\/a>.<\/p>\n\n\n\n Die passende Methode richtet sich nach der wissenschaftlichen oder diagnostischen Fragestellung. Eine gezielte RT-qPCR eignet sich, wenn eine definierte Gen-Signatur zuverl\u00e4ssig und reproduzierbar gemessen werden soll. Sie konzentriert sich auf wenige, vorab ausgew\u00e4hlte Marker und ist daher f\u00fcr standardisierte Workflows besonders geeignet.<\/p>\n\n\n\n Breite Transkriptomverfahren wie RNA-Sequenzierung erfassen dagegen zahlreiche RNA-Molek\u00fcle gleichzeitig und werden vor allem eingesetzt, um neue Muster oder Kandidatengene zu erforschen. Diese Verfahren erzeugen umfangreiche Datens\u00e4tze und erfordern entsprechend komplexe bioinformatische Auswertungen. Eine breite Transkriptomanalyse ist nicht dasselbe wie eine zielgerichtete Biomarkeranalyse.<\/p>\n\n\n\n Entz\u00fcndliche Dermatosen k\u00f6nnen klinisch und histopathologisch \u00fcberlappende Merkmale zeigen. Definierte Genexpressionssignaturen k\u00f6nnen hier objektive molekulare Ergebnisse f\u00fcr die diagnostische Beurteilung liefern. Diese Ergebnisse werden im Zusammenhang mit den klinischen Angaben und histopathologischen Befunden interpretiert.<\/p>\n\n\n\n Dermagnostix entwickelt dermatologiespezifische Systeme zur automatisierten Messung ausgew\u00e4hlter Genexpressionsmarker. PsorX ist ein CE-IVD-Produkt zur RT\u2011qPCR-basierten Differenzierung von Psoriasis und Ekzem in FFPE-Hautgewebe anhand der Marker NOS2 und CCL27. RNA-Extraktion, RT\u2011qPCR und Ergebnisermittlung erfolgen in einem geschlossenen, automatisierten Workflow. Vertiefende Evidenz und Validierungen finden Sie in unseren Publikationen und Studien<\/a>.<\/p>\n\n\n\nGezielte RT-qPCR oder Transkriptomanalyse?<\/h2>\n\n\n\n
Genexpressionsanalyse\u00a0bei entz\u00fcndlichen Hauterkrankungen<\/h2>\n\n\n\n
Genexpressions-Biomarker f\u00fcr die dermatologische Forschung<\/h2>\n\n\n\n